تجزیه و تحلیل پروتئوم عصاره پروتئینی باکتری Xanthomonas citri subsp. citri با خاصیت محرکی بر روی گیاه آرابیدوپسیس

در حال حاضر پژوهش های وسیعی در موسسات پژوهشی در دنیا در حال انجام است که هدف آنها یافتن محرکهایی (الیسیتورهای) جدید از میکروارگانیسم­ها و گیرنده­های آنها از گیاهان می­باشد. شناخت کامل این محرکها و گیرنده­های مربوط به آنها، امکان استفاده از آنها جهت ایجاد گیاهان تراریخته مقاوم به بیمارگرهای گیاهی را امکان پذیر می­سازد. با توجه به اینکه تولید اتیلن گیاه مدل آرابیدوپسیس تالیانا در واکنش به تیمار محرکهای میکروبی به شدت افزایش می­یابد، در این مطالعه از آزمون سنجش اتیلن برای خالص سازی و بررسی پروتئین­هایی با خاصیت محرک از باکتری (Xcc) Xanthomonas citri subsp. citri  استفاده شد. برای این منظور عصاره پروتئینی این باکتری تهیه و خالص سازی شد و سپس نمونه خالص شده که در آزمون سنجش اتیلن خاصیت محرکی داشت، با استفاده از طیف سنجی جرمی متوالی مورد تجزیه و تحلیل قرار گرفت. حدود 60 پروتئین مختلف در نمونه مورد بررسی شناسایی شد که از بین موارد شناسایی شده تنها سه مورد از نظر جرم مولکولی و نقطه ایزوالکتریک مشابه محرک مشاهده شده در عصاره پروتئینی باکتری Xcc بودند. این پروتئین­ها عبارتند از cspA (پروتئین شوک سرمایی A)، csrA (پروتئین تنظیم­گر ذخیره کربن) و یک پروتئین ناشناخته فرضی محافظت شده که از خانواده پروتئینی DUF1456 می­باشد. با بررسی­هایی که در نرم افزارهای SOSUI وPSORTB صورت گرفت مشخص شد که این پروتئین ناشناخته فرضی قابل حل در آب بوده و هیچگونه توالی مرتبط با غشاء­های باکتری را ندارد و بنابراین به احتمال زیاد جزء پروتئین­های سیتوپلاسمی محسوب می­شود.